多年来，体育教学部坚持科研与教学相结合，坚持科学研究在教学改革和学科建设中的重要地位。体育教学部坚持实行“体育教师科研成果奖励办法”，鼓励教师不仅要增加科研数量，更要提高科研质量。2000年至2006年间，体育教学部超额完成科研工作量262.44％，已出版学术著作8部，发表论文二百余篇，参加奥运组织管理国际研讨会、世界大学生科学论文报告会、东亚体育科学大会、全国大学生运动会体育科报会等学术会议达到二百余人次。获全国大学生体育论文二等奖2篇，三等奖4篇，近三年间，体育教学部获上海市体育论文一等奖十三篇，二等奖三十四篇、三等奖十二篇，5篇论文在国际体育学术会议上报告和交流。承担国家体育总局研究项目一项，上海市决策咨询项目4项。此外，还承接国家体育总局、全国高等教育学会、上海市高等教育学会、上海市教委、上海市体育局等多项课题研究，多项成果获得校级、市级及国家级奖励。